دینوکوکوس-ترموس

Deinococcus–Thermus
رده‌بندی علمی
حوزه:	باکتری
شاخه:	Deinococcus–Thermus
رده:	دینوکوکوس-ترموس
Orders & Families
	دینوکوکوس-ترموس دینوکوکوس Trueperaceae ترمال‌ها *Thermaceae;
مترادف
	Deinococcaeota Oren et al. 2015;

دینوکوکوس-ترموس یک شاخه از باکتری‌ها است که بسیار مقاوم به خطرات زیست‌محیطی هستند و همچنین به عنوان شدیددوست‌ها شناخته می‌شوند.

این باکتری‌ها دیواره سلولی ضخیمی دارند که آنها را سویه‌های گرم مثبت می‌سازد، اما آنها غشا دومی نیز دارند و بنابراین در ساختار به باکتریهای گرم منفی نزدیکترند. کاوالیر-اسمیت این کلاد را هدوباکتریا خواندند. (گرفته شده از هادس، جهان زیرزمینی یونانی).

طبقه‌بندی

شاخهٔ دینوکوکوس-ترموس متشکل از یک ردهٔ (دینوکوکی) و دو راسته است:

دینوکوکال‌ها شامل دو تیره (دینوکوکاسا و تروپراسا) با سه سردهٔ دینوکوکوس، دینوباکتریوم و تروپرا است. تروپرا رادیوویکتریکس اولین عضو متفرقهٔ راسته است. درون راسته، با توجه به گونه‌های دینوباکتریوم و تروپرا، دینوکوکوس یک خوشهٔ گروه فراگیر مجزا است. این سرده شامل چندین گونه است که به اشعه مقاوم هستند؛ آنها برای توانایی خود در خوردن زباله‌های هسته‌ای و سایر مواد سمی، زنده ماندن در خلاء و زنده ماندن در سرما و گرمای شدید معروف هستند.
ترمال‌ها شامل چندین سردهٔ مقاوم در برابر گرما (مارینیترموس، میوترموس، اوشنیترموس، ترموس، ولکانیترموس، رابدوترموس) قرارگرفته در تیرهٔ می‌باشد. تجزیه و تحلیل تبارزایی نشان می‌دهد که در ترمال‌ها، با توجه به مارینیترموس، اوشنیترموس، ولکانیترموس و رابدیترموس که به عنوان گروه‌های خارجی درون راسته هستند، گونه‌های میوترموس و ترموس یک گروه فراگیر را تشکیل می‌دهند. . این موضوع پیشنهاد می‌کند که گونه‌های میوترموس و ترموس نسبت به دیگر سرده‌های درون راسته به هم نزدیکتر هستند. ترموس آکواتیکوس در توسعهٔ PCR برای استفاده از آنزیم DNAپلیمراز مقاوم به گرما بسیار مهم بود.

هر چند این دو گروه از یک جد مشترک تکامل یافته‌اند، دو مکانیسم مقاومت تا حد زیادی مستقل از هم به نظر می‌رسد.

منابع

↑ Griffiths E, Gupta RS (September 2007). "Identification of signature proteins that are distinctive of the Deinococcus–Thermus phylum" (PDF). Int. Microbiol. 10 (3): 201–8. PMID 18076002. Archived from the original (PDF) on 2011-06-14.
↑ Gupta RS (2011). "Origin of diderm (Gram-negative) bacteria: antibiotic selection pressure rather than endosymbiosis likely led to the evolution of bacterial cells with two membranes". Antonie Van Leeuwenhoek. 100 (2): 171–182. doi:10.1007/s10482-011-9616-8. PMC 3133647. PMID 21717204.
↑ Campbell C, Sutcliffe IC, Gupta RS (2014). "Comparative proteome analysis of Acidaminococcus intestini supports a relationship between outer membrane biogenesis in Negativicutes and Proteobacteria". Arch Microbiol. 196 (4): 307–310. doi:10.1007/s00203-014-0964-4. PMID 24535491.
↑ Sutcliffe IC (2010). "A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture". Trends Microbiol. 18 (10): 464–470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.
↑ Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct. 1: 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19. PMC 1586193. PMID 16834776. Archived from the original on 18 December 2019. Retrieved 10 July 2017.
↑ Albuquerque L, Simões C, Nobre MF, et al. (2005). "Truepera radiovictrix gen. nov. , sp. nov. , a new radiation resistant species and the proposal of Trueperaceae fam. nov". FEMS Microbiol Lett. 247 (2): 161–169. doi:10.1016/j.femsle.2005.05.002. PMID 15927420.
↑ Garrity GM, Holt JG. (2001) Phylum BIV.
↑ Garrity GM, Bell JA, Lilburn TG. (2005) Phylum BIV.
↑ Ho J, Adeolu M, Khadka B, Gupta RS (2016). "Identification of distinctive molecular traits that are characteristic of the phylum "Deinococcus-Thermus" and distinguish its main constituent groups". Syst Appl Microbiol. 39 (7): 453–463. doi:10.1016/j.syapm.2016.07.003. PMID 27506333.
↑ Battista JR, Earl AM, Park MJ (1999). "Why is Deinococcus radiodurans so resistant to ionizing radiation?". Trends Microbiol. 7 (9): 362–5. doi:10.1016/S0966-842X(99)01566-8. PMID 10470044.
↑ «نسخه آرشیو شده». بایگانی‌شده از اصلی در ۲۷ ژانویه ۲۰۱۳. دریافت‌شده در ۱۰ ژوئیه ۲۰۱۷.
↑ Nelson RM, Long GL (1989). "A general method of site-specific mutagenesis using a modification of the Thermus aquaticus". Anal Biochem. 180 (1): 147–151. doi:10.1016/0003-2697(89)90103-6. PMID 2530914.
↑ "Comparative genomics of Thermus thermophilus and Deinococcus radiodurans: divergent routes of adaptation to thermophily and radiation resistance". BMC Evol. Biol. 5: 57. 2005. doi:10.1186/1471-2148-5-57. PMC 1274311. PMID 16242020.

[pmid_18076002-1] Griffiths E, Gupta RS (September 2007). "Identification of signature proteins that are distinctive of the Deinococcus–Thermus phylum" (PDF). Int. Microbiol. 10 (3): 201–8. PMID 18076002. Archived from the original (PDF) on 2011-06-14.

[pmid_21717204-2] Gupta RS (2011). "Origin of diderm (Gram-negative) bacteria: antibiotic selection pressure rather than endosymbiosis likely led to the evolution of bacterial cells with two membranes". Antonie Van Leeuwenhoek. 100 (2): 171–182. doi:10.1007/s10482-011-9616-8. PMC 3133647. PMID 21717204.

[pmid_24535491-3] Campbell C, Sutcliffe IC, Gupta RS (2014). "Comparative proteome analysis of Acidaminococcus intestini supports a relationship between outer membrane biogenesis in Negativicutes and Proteobacteria". Arch Microbiol. 196 (4): 307–310. doi:10.1007/s00203-014-0964-4. PMID 24535491.

[pmid_20637628-4] Sutcliffe IC (2010). "A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture". Trends Microbiol. 18 (10): 464–470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.

[pmid_16834776-5] Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct. 1: 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19. PMC 1586193. PMID 16834776. Archived from the original on 18 December 2019. Retrieved 10 July 2017.

[pmid_15927420-6] Albuquerque L, Simões C, Nobre MF, et al. (2005). "Truepera radiovictrix gen. nov. , sp. nov. , a new radiation resistant species and the proposal of Trueperaceae fam. nov". FEMS Microbiol Lett. 247 (2): 161–169. doi:10.1016/j.femsle.2005.05.002. PMID 15927420.

[Garrity1-7] Garrity GM, Holt JG. (2001) Phylum BIV.

[Garrity2-8] Garrity GM, Bell JA, Lilburn TG. (2005) Phylum BIV.

[pmid_27506333-9] Ho J, Adeolu M, Khadka B, Gupta RS (2016). "Identification of distinctive molecular traits that are characteristic of the phylum "Deinococcus-Thermus" and distinguish its main constituent groups". Syst Appl Microbiol. 39 (7): 453–463. doi:10.1016/j.syapm.2016.07.003. PMID 27506333.

[pmid_10470044-10] Battista JR, Earl AM, Park MJ (1999). "Why is Deinococcus radiodurans so resistant to ionizing radiation?". Trends Microbiol. 7 (9): 362–5. doi:10.1016/S0966-842X(99)01566-8. PMID 10470044.

[11] «نسخه آرشیو شده». بایگانی‌شده از اصلی در ۲۷ ژانویه ۲۰۱۳. دریافت‌شده در ۱۰ ژوئیه ۲۰۱۷.

[pmid_2530914-12] Nelson RM, Long GL (1989). "A general method of site-specific mutagenesis using a modification of the Thermus aquaticus". Anal Biochem. 180 (1): 147–151. doi:10.1016/0003-2697(89)90103-6. PMID 2530914.

[pmid_16242020-13] "Comparative genomics of Thermus thermophilus and Deinococcus radiodurans: divergent routes of adaptation to thermophily and radiation resistance". BMC Evol. Biol. 5: 57. 2005. doi:10.1186/1471-2148-5-57. PMC 1274311. PMID 16242020.